Covid-19 : tout ce que la science sait déjà sur XE, la nouvelle sous-variété d’Ômicron
En plus du Deltacron — qui mélange les variantes Delta et Omicron du virus qui cause le Covid-19 — une nouvelle recombinaison génétique a retenu l’attention des autorités sanitaires.
Résultat d’un mélange entre les sous-lignées BA.1 et BA.2 d’Ômicrons, aujourd’hui courantes dans le monde, la sous-variante connue sous le nom de XE semble plus transmissible, mais n’a pas encore été identifiée par l’Organisation mondiale de la santé comme un sujet de préoccupation soins vus (OMS). De plus, les données initiales n’indiquaient pas d’augmentation de la gravité de l’infection.
« Aucun des recombinants actuellement observés n’est encore considéré comme une variante préoccupante. Ils sont surveillés et circulent depuis quelques mois maintenant. Même s’ils ont une bizarrerie, s’ils ne chevauchent pas BA.2, ils finiront par disparaître. Mais ces données doivent être prises en compte », explique le généticien Salmo Raskin, directeur du laboratoire Genetika à Curitiba.
Voici tout ce que nous savons sur le XE jusqu’à présent :
Qu’est-ce qu’une recombinaison ?
Un variant de recombinaison se produit lorsqu’une même personne est simultanément infectée par deux souches différentes, ou deux souches du même variant, qui mélangent leur matériel génétique à l’organisme du patient. C’est un processus courant dans les virus qui s’est produit à d’autres moments de la pandémie.
« Les variantes recombinantes ne sont pas rares, en particulier lorsque plusieurs variantes sont en circulation et que plusieurs ont été identifiées jusqu’à présent au cours de la pandémie », a déclaré Susan Hopkins, conseillère médicale en chef de l’Agence de sécurité sanitaire du pays (UKHSA). Susan Hopkins., dans un communiqué.
Quand XE a-t-il été découvert ?
La combinaison des sous-lignées BA.1, connues sous le nom de µmicron original, et BA.2 a donné naissance à la sous-variante dite XE, qui a été détectée pour la première fois au Royaume-Uni le 19 janvier de cette année.
Selon la dernière mise à jour de l’autorité sanitaire du pays, 637 cas de la nouvelle sous-variante ont été détectés jusqu’à présent. Le Royaume-Uni est l’un des principaux lieux du processus de surveillance génétique du Sars-CoV-2 dans le monde.
Le XE est-il plus portable ?
Selon la dernière mise à jour du bulletin épidémiologique de l’OMS, les premières données indiquent que XE serait environ 10% plus transmissible que BA.2 – qui à son tour est plus transmissible que son prédécesseur, BA.1, selon une étude danoise . Cependant, l’organisation souligne que davantage d’études sont nécessaires pour montrer une différence significative.
Les vaccins fonctionnent-ils contre XE ?
Il n’y a toujours pas de données sur l’efficacité des vaccins actuels dans la protection contre la sous-variante XE. Cependant, l’OMS souligne que la nouvelle sous-lignée fait partie d’Ômicron et, jusqu’à ce que de nouveaux changements pertinents soient découverts, a tendance à se comporter de cette façon. Avec cela, on s’attend à ce que, comme c’est le cas pour BA.1 et BA.2, le calendrier vaccinal, en particulier avec les trois doses, soit efficace pour prévenir les conséquences graves du Covid-19.
XE est-il plus sérieux ?
Comme pour la résistance aux vaccins, il n’y a toujours pas d’informations sur la sévérité de la sous-variante XE. Cependant, des études montrent qu’Ômicron est moins agressif que les variantes précédentes du virus qui cause le Covid-19, car il est plus contagieux dans les voies respiratoires supérieures, causant ainsi moins de dommages aux poumons. Étant donné que BA.2 présente une infection similaire à BA.1, la condition causée par XE devrait également être similaire à ses prédécesseurs, explique le généticien Salmo Raskin.
Y a-t-il lieu de s’inquiéter?
Il n’y a pas encore assez d’informations pour croire que XE résistera à la protection vaccinale et déclenchera une autre vague de Covid-19. Selon le rapport de l’OMS, « XE appartient à la variante Omicron jusqu’à ce que des différences significatives dans les caractéristiques de transmission et de la maladie, y compris la gravité, puissent être signalées ».
Susan Hopkins, de l’Agence britannique de la santé, souligne également que la transmissivité plus élevée que XE devrait être ne signifie pas nécessairement qu’elle deviendra prédominante dans le monde, comme ce fut le cas avec BA.1.
« Ce recombinant particulier, XE, a montré un taux de croissance variable, mais nous ne pouvons pas encore confirmer s’il a un réel avantage en termes de croissance », a-t-elle déclaré dans un communiqué.
« Deltacron » : ce que l’on sait des recombinaisons XF et XD
En plus de XE, le service de santé britannique surveille deux autres recombinaisons : XF et XD, toutes deux de Delta (AY.4) avec la souche originale BA.1 d’Omicron, connue sous le nom de Deltacron.
38 cas de XF ont été trouvés au Royaume-Uni jusqu’à présent, mais aucun depuis la mi-février, ce qui suggère qu’il n’y a pas de transmission communautaire. XD a été identifié dans 49 cas, mais aucun au Royaume-Uni et la plupart en France, y compris il y a plus d’un mois.
Le généticien Salmo Raskin explique qu’il y avait des inquiétudes concernant une augmentation de la transmissibilité, de la gravité ou de l’échappement du vaccin recombinant d’Omicron avec Delta, ce qui ne s’est pas produit dans la vraie vie.
« Cela ne semble pas se produire. Et puisque XD a la région du récepteur Spike exactement la même qu’Omicron BA.1, XD semble se comporter très bien comme Omicron. C’est parce que cette région du génome du virus est la plus importante en termes de sa capacité à infecter les défenses et à s’échapper », explique le spécialiste.
Une étude menée par des chercheurs de l’Institut Pasteur en France, qui est toujours en cours d’examen par les pairs pour publication, était chargée d’identifier la similitude du récepteur de la protéine Spike. Le travail a également analysé les deux variantes (XD et Omicron BA.1) et a constaté qu’il n’y a pas de différences significatives dans la résistance aux vaccins.
Pris ensemble, ces résultats indiquent que XD présente des propriétés d’évasion immunitaire similaires à celles de BA.1″, ont écrit les chercheurs.
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